Uno de los acuerdos de la Tercera Asamblea Nacional de la NCCP, realizada en Las Margaritas, Chiapas, fue conformar una Coordinación Nacional, integrada por 2 representantes (una mujer y un hombre) de cada estado, así como uno o dos representantes de las comisiones de Educación Popular y Trabajo de Base, Comunicación, Enlace y Relaciones Estratégicas, y Economía Solidaria.
En nuestra primera asamblea de la Coordinación Nacional, se dieron los informes de los comités y concejos estatales, así como de las comisiones. Además, se discutió sobre el fortalecimiento de los comités y concejos locales, sobre la descentralización y regionalización del trabajo. Se realizó un primer balance sobre la coyuntura electoral que se abre hacia el 2018, sobre la cual hemos reconocido la necesidad de seguir discutiendo y reflexionando para avanzar conforme al horizonte estratégico planteado por la NCCP. Por último, se discutió sobre la necesidad de realizar los Encuentros de las Resistencias en todos los estados, ya que de estos se generará el trabajo previo al 5 de febrero de 2017, fecha en la que se conmemora el centenario de la Constitución de 1917, en la que se planea realizar un acto nacional en el que se compartan los avances y trabajos de la NCCP, la articulación con la resistencia antineoliberal, y el inicio de un proceso de Justicia Transicional, amparándonos en la constitución actual para juzgar al Estado Mexicano por el desvío de poder y sus múltiples crímenes de lesa humanidad contra el pueblo mexicano.